Laboratórna diagnostika infekčných chorôb

Bežné typy testov zahŕňajú mikroskopia, testovacie kultúra, imunologické testy (testy aglutinácia, napríklad latexová aglutinácia, enzýmové imunoanalýzy, western blot, testy zrážanie a fixáciu komplementu test) a spôsoby identifikácie nukleové a non-nukleové kyseliny. Obvykle test kultúra - je zlatý štandard pre identifikáciu mikroorganizmov, ale výsledky nemusia byť k dispozícii niekoľko dní alebo týždňov. Okrem toho patogény môžu byť izolované v kultúre, čo ich robí užitočné alternatívne testy. Keď sa patogén vykonáva testovacie kultúry, a to je identifikovaný, môže laboratórium tiež hodnotiť jeho citlivosť na antibiotiká.

Niektoré testy (napr., Gramovo farbenie, obvyklá aeróbne kultúry) môže detekovať širokú škálu patogénov. V rovnakej dobe, niektoré patogény nemôžu byť v analýze identifikované. Z tohto dôvodu, lekári by mali byť vedomí obmedzenia každý test pre špecifické mikroorganizmy. V takýchto prípadoch by lekári mali vyžiadať vykonanie skúšok, ktoré sú špecifické pre podozrenie z patogénu (napr špeciálnych farbív alebo médium pre kultúru) alebo odporúčať určité laboratórne testy na výber.

mikroskopia

Mikroskopia môže byť vykonané rýchlo, ale presnosť je závislá na skúsenostiach pracovníkom laboratória a kvality zariadení. Inštrukcie často obmedzujú využitie lekárov mikroskopia na diagnostické účely je certifikovaný laboratórií.

Väčšina vzoriek ošetrených farbív, ktoré farebné patogény, ktoré ich robia vyčnievať z davu, aj keď môžu byť použité mokré preparáty unstained vzorky pre detekciu húb, parazitov, informatívne články z pošvy, mobilné organizmy (napr Trichomonas) a syfilis (mikroskopia, tmavé pole ). Detekcia húb možno zlepšiť použitím 10% hydroxidu draselného sa na rozpustenie okolité tkanivá a non-hubových organizmov.

Ošetrujúci lekár požiadal o maľbu na základe pravdepodobných patogénov, ale nie farbenie nie je 100% špecifická. Väčšina vzoriek spracováva Gramovo farbenie, a ak je podozrenie na mykobaktérií, kyseliny farbenie. Avšak, niektoré patogény sú ťažké vidieť pri použití týchto metód. V takýchto prípadoch vyžadujú rôzne verzie sfarbenie alebo iných identifikačných metód. Vzhľadom k tomu, mikroskopická detekcia mikrób všeobecne vyžaduje koncentráciu asi 1h105 / ml, väčšina vzorky biologických tekutín (napr., CSF), koncentrované (napríklad odstreďovaním) pred analýzou.

gram farbenie. Gramovo farbenie klasifikuje baktérie podľa toho, či zachovať kryštalickej fialovej škvrnu (grampozitívne - modrá) alebo nie (g - červená). Okrem toho sa ukazuje morfológiu buniek (napr., Bacily, koky) a jeho usporiadanie (napríklad diploidný klastra reťazcom). Tieto funkcie môžu pomôcť v predvýberu antibiotík pri čakaní na konečnú identifikáciu. K výrobe farbenie podľa Grama, laboratórne materiál zahrieva a pevných vzoriek na snímke, a potom sa zafarbia postupne Gramovo farbenie fialovej, jódu, acetón a kontrastné farbivo (zvyčajne safranín).

Kyselinu a mierne (modifikovaných) Kyslé farbivá. Takáto farbivá sa používajú na identifikáciu organizmov odolné proti kyselinám (Mycobacterium sp.) A stredne odolná voči kyselinám organizmov (najmä Nocardia sp.). Tieto farbivá sú tiež užitočné pre farbenie rody Rhodococcus a podobne, rovnako ako oocysty niektorých parazitov (napr., Cryptosporidium).

Aj keď detekcia mykobaktérií v spúte vyžaduje iba približne 5 000 až 10 000 mikroorganizmov / ml, mykobaktérie sú často prítomné v ľudskom tele na nižších úrovniach, takže citlivosť je obmedzená. Zvyčajne sa niekoľko ml spúta deaktivovať hydroxidu sodného a koncentrované centrifugáciou a kyselinová farbenie. To zlepšuje diagnózu, hoci niektoré mierne kyslé odolné organizmy je ťažké odlíšiť od mykobaktérií.

fluorescenčné farbenie. Takáto farbivá umožňujú detekciu patogénov pri nižších koncentráciách (1x10⁴ buniek / ml). Príklady - akridínové oranž (baktérie a plesne), auraminom rhodamin a auraminom O (mykobaktérie) a kalkoflyuor biela (huby, najmä dermatofyty).

Zlúčenina fluorescenčného farbiva do protilátkou namierenou na patogénu (priame alebo nepriame imunofluorescenčné) zvyšuje citlivosť a špecifickosť diagnózy. Avšak tieto testy sú ťažko čítať a interpretovať, a niekoľko (napr, priame testy fluorescencie a pneumóniu Legionella protilátky) sú komerčne dostupné a bežne používané.

farbenie atrament. Toto farbivo sa používa na detekciu hlavne Cryptococcus neoformans a ďalšie skryté huby vo forme suspenzie premytých buniek (napr., CSF zrazenina). Farebný sekundárne domény a nie telo sám, vďaka ktorému je možné vidieť žiadne kapsule okolo tela ako svätožiara. Pri iných patogénov skúška nie je tak citlivý ako detekcia kryptokokovou antigénu. Špecifickosť metódy je tiež obmedzený: biele krvinky môžu objaviť skryté patogény.

Wright Giemsa farbenia a. Takáto farbivá sa používajú na detekciu parazitov v krvi, Histoplasma capsulatum fagocyty a tkanivové bunky, intracelulárne inklúzie tvorené vírusy a chlamýdie trophozoites pneumónie jirovecii a určité intracelulárnu baktérie.

Trichromatickým farbenie (farbenie Gömöri - Wheatley) a železný hematoxylínom farbenie. Tieto farbivá sa používajú na detekciu črevnej prvokmi.

Dye Gömöry - Whitley sa používa na detekciu Microsporidia. Nemôže odhaliť helminthů vajcia a lichinki- nemožno spoľahlivo identifikovať Cryptosporidium. Huby a ľudské bunky sú tiež zafarbené.

Železo hematoxylín zafarbenie diferencované bunky, aktivuje bunky a jadrá. hlísty vajcia možno natierať v tmavej farbe, čo sťažuje identifikáciu.

kultúra

Testovacia kultúra - mikrobiálny rast na pevnom alebo kvapalnom zvýšenie živín polovici počtu organizmov uľahčuje identifikáciu. Kultúra tiež uľahčuje testovanie citlivosti k antibiotikám.

Video: Diagnóza zápalu močového mechúra. Part 3 052-2506596

Komunikácia s laboratóriom je dôležitá. Hoci väčšina materiálu vzorky naočkuje na všeobecné použitie média (napr., Krvi alebo čokoládový agar), niektoré patogény vyžadujú zahrnutie niektorých živín a inhibítory alebo iné špeciálne úslovím - Ak jedna z týchto patogénov je podozrenie, alebo v prípade, že pacient dostal antibiotiká, je nutné hlásiť do laboratória. O zdrojmi správy vzorky tieto údaje do laboratória môžu diferencovať patogénov z normálnej flóry.

Vzorkovanie je dôležitá. Nesprávny typ tampónu môže viesť k falošne negatívnym výsledkom. Drevené tyčinky pre tyče ster toxické k niektorým vírusom. Palice s bavlnenou handričkou špičky toxický pre niektoré baktérie a chlamýdie. Krvné kultúry vyžadujú dekontamináciu a dezinfekciu kože (napr., Povidón jód tampóny sa nechajú vyschnúť a so odstráni 70% alkoholu). Bežne sa používa niekoľko vzoriek, z ktorých každý zo samostatného plotu mesta- s výhodou vykonáva pri výške horúčky, pokiaľ je to možné. Normálne flóra kože a slizníc, ktorý rastie dokonca istej vzorke krvi, pôsobí ako infikovaný. Ak je vzorka krvi získaný z centrálnej žily alebo tepny, treba tiež zobrať vzorky periférnej krvi pomôcť rozlíšiť systémovú bakterémia z katétra infekcie. Kultúra infikovaných katétrov sa zvyčajne stávajú pozitívne rýchlejšie a obsahuje viac ako organizmy oboch kombinovaných kultúr periférnej krvi. Niektoré huby, najmä pôdy (napríklad Aspergillus sp.), Zvyčajne nemôžu byť kultivovaný od vzoriek krvi.

Vzorka by mal byť rýchlo prepravovať vo vhodnom médiu a za podmienok, ktoré obmedzujú rast iných potenciálne infikovanie flóry. Pre presné stanovenie množstva patogénu byť zabránené rastu patogénnych ďalšie kópie musia byť okamžite transportované do laboratória, alebo, ak je dopravné oneskorenie, ktoré v chladničke (vo väčšine prípadov).

Existujú špeciálne podmienky pre určité plodiny.

Anaeróbne baktérie by nemali byť študované v testovacej kultúre, as diferenciáciu patogénov z normálnej flóry často nemožné. Vzorky vzorky by mali byť chránené pred vzduchom. anaeróbne transportné médiá sa používajú pre ťahy štetcom. Vzorky vzorky odobraté pomocou injekčnej striekačky (napríklad obsah absces), sa musí prepravovať v injekčnej striekačke.

Mykobaktérie je ťažké pestovať. Vzorky, ktoré obsahujú normálny flóru (napr., Spúte), musí byť najprv deaktivovaná a koncentruje sa. Mycobacterium tuberculosis a niektoré iné mykobaktérie rastú pomaly. Rast M. tuberculosis, sa objavujú rýchlejšie ako v kvapalinách v pevnom médiu. Typicky je použitie automatizovaných systémov s kvapalným médiom môže zvýšiť v priebehu 2 týždňov v porovnaní s >4 týždne na pevnom médiu (agar Lowenstein - Jensen). Navyše, malé množstvo organizmov, môže byť prítomný v kópii. Plotové viac inštancií na rovnakom mieste, môže pomôcť zvýšiť pravdepodobnosť detekcie patogénu. V priebehu 8 týždňov nesmie miešať naočkuje médium. Ak je podozrenie na atypickú Mycobacterium, mal by informovať laboratórium.

Vírusy typicky pestujú na náteroch a vzorkách tkanív, zvyčajne prepravované v prostrediach, ktoré obsahujú antibakteriálne a antifungálne činidlá. Obsah vzoriek vrúbľovať vzoriek v tkanivovej kultúre, ktoré podporujú rast vírusu a inhibujú všetky ostatné mikróby. Vírusy sú veľmi nestabilné (napríklad zoster) sa naočkujú do kultivačného tkanive v priebehu 1 hodiny po odbere. Štandardná tkanivové kultúry je najcitlivejšia. Express tkanivové kultúry buniek (plaku metóda: počítanie bodov na monovrstvě buniek) môže poskytnúť rýchlejší, ale svedčí o výsledkoch. Niektoré bežné vírusy nemôžu byť detekované za použitia obvyklých metód kultivácie tkaney- vyžadujú alternatívne metódy diagnostiky.

Vzorky huby odvodené z nesterilných miest sa očkuje do prostredia, ktoré obsahuje antibakteriálne činidlo. Inštancie sa musia uchovávať po dobu 4 týždňov pred likvidáciou.

test citlivosti

Analýzy citlivosti určiť mikrobiálnu rezistenciu voči antibiotikám vystavením štandardizované koncentrácie antibakteriálnych liekov. Analýza citlivosti môže byť vykonané pre baktérie, plesne a vírusy. U niektorých organizmov, výsledky získané z jedného liečiva predvídať výsledky týchto liečiv. Tak, nie všetky potenciálne sú testované účinné liečivá.

Test citlivosti sa vykonáva in vitro, a nemusia brať do úvahy veľa faktorov, prírodné podmienky (napríklad farmakokinetika a farmakodynamika, funkcia koncentrácia lieku v niektorých tkanivách a orgánoch ľudského tela imunitného systému), ktoré majú vplyv na úspešnosť liečby. To znamená, že výsledky testov na citlivosť nie je vždy predvídať výsledok liečby.

Citlivosť testu môže byť kvalitatívne, semikvantitatívne alebo za použitia metód na izoláciu nukleových kyselín. Analýza môže tiež vyhodnotiť účinok kombinovanej použitie rôznych antibakteriálnych liečiv (test spoločné účinky).

kvalitatívne metódy. Kvalitatívne metódy sú menej presné než semikvantitatívny. Podľa výsledkov normálne pevné citlivosti (S), medziproduktu výsledok (I) alebo jej odpor (R). Najčastejšie sa používa metóda diskové difúzie (tiež známy ako testovacie Kirby - Bauer) vhodné pre rýchlo rastúcich organizmov.

Antibiotikum napustené disky boli umiestnené do agarové misky, na ktorých sa testuje mikroorganizmus. Po inkubácii (zvyčajne 16 až 18 hodín) sa meria priemer inhibičnej zóny okolo každého disku. Každá kombinácia antibiotiká mikroorganizmus majú rôzne priemery, ktoré majú hodnotu S, I, alebo R.

Iné metódy, ktoré vyžadujú menej prísne dodržiavanie testovacích parametrov môžu byť použité pre rýchlu kontrolu individuálne organizmus rezistentné na konkrétny liek alebo triedu liekov alebo špecifických antibakteriálnych kombinácie (napr., Odolnosť voči oxacilín v meticilín-rezistentný Staphylococcus aureus, výroba B-laktamázy).

Semi-kvantitatívne metódy. Semikvantitatívne spôsoby stanovenie minimálnej koncentrácie liečiva, ktoré inhibuje rast určitého organizmu in vitro. Minimálne inhibičné koncentrácie (MIC) sa stanoví ako číslo, ktoré potom môžu byť považované za jeden z troch skupín: S (citlivé), I (stredný), alebo (rezistentné) R. MIC Stanovenie sa používa hlavne pre baktérie, vrátane anaeróby a Mycobacterium je niekedy používaný k hubám, najmä druhu Candida, odvodených zo sterilných miest. Koncentrácia Minimálne neutralizuje (baktericídne) (MBC), môže byť tiež stanovená, ale je technicky obtiažne, a normy pre interpretáciu doteraz dohodnuté. MBC analýza je hodnota, znamená to, či liek môže byť bakteriostatický alebo baktericídny.

Antibiotikum môže byť rozpustený v agare alebo pôda, ktorá sa potom pridá do mikroorganizmu. Zosvetlenie vývar - zlatý štandard, ale je to časovo náročné, pretože len jedna koncentrácie liečiva môžu byť testované v jednej skúmavke. Účinnejší spôsob používa pás polyesterovej fólie pásu impregnovaného zodpovedajúce antibiotikum koncentráciu. Prúžok sa umiestni na agarovom misku obsahujúci vloženie materiálu, a IPC určuje umiestnenie na páse, ktorý začína ingibitsiya- veľké množstvo antibiotík môže byť kontrolovaná na tú istú dosku.

IPC umožňuje koreláciu medzi citlivosť mikroorganizmu na liečivá a koncentrácie liečiva v dosiahnuteľné látky, non-proteín (bez liečiva). V prípade, že koncentrácia voľného liečiva v tkanive je vyššia ako MIC, pravdepodobnosť úspešnej liečby je vysoká. Podobne údaje o S, I a R sú v korelácii s BMD. Zvyčajne sú založené na dosiahnuteľných koncentráciách voľného liečiva v sére alebo plazme.

Metódy pre detekciu nukleových kyselín,. Tieto testy sú založené na metódach detekcie nukleových kyselín, podobných tým, ktoré slúži na identifikáciu mikroorganizmu, ale upravený pre detekciu známych génov rezistencie alebo mutácie. Príklad - Meca, gén rezistencie na oxacilín v S. aureus-, ak je prítomný gén, organizmus sa za rezistentné voči všetkým-laktámových antibiotík. Aj keď je známe veľa takých génov, ale ich identifikácia nie je oprávnená určitú záveru o odpore in vivo. Okrem toho, pretože sa môžu predstaviť nové mutácie alebo iné gény rezistencie, ich neprítomnosť nezaručuje citlivosti na liečivá. Z týchto dôvodov a preto, že testy sú obmedzené čo do počtu a sú drahé, nie sú široko používané. Metódy pre detekciu nukleových kyselín, nenahrádza štandardné testovacie kultúry a obvyklú analýzu citlivosti.

Imunologické testy na infekčné choroby

Imunologické testy s použitím antigén pre detekciu protilátok proti patogénu alebo protilátku na detekciu patogénny antigén vo vzorke pacienta. Liečba sa líšia, ale ak potrebujete odložiť analýzu vzorky, spravidla by mal byť umiestnený v chladničke alebo zmrazenia, aby sa zabránilo premnoženiu baktérií.

aglutinačné testy. V aglutinácia sa testy (napr., Latexový aglutinácia, koaggregatsiya) častice (latexová gulička alebo baktérie), pripojený k činidlá antigénu alebo protilátky. Výsledné častice komplexu sa zmiešajú so vzorkou (napr., CSF, sérum) - ak je to žiaduce protilátka alebo jej antigén prítomný vo vzorke, zesíťovací častíc sa vyskytuje vo forme aglutinácia, ktorá môže byť meraná.

Ak sú výsledky pozitívne, skúmaná biologická tekutina postupne nariedia a testované. Aglutinácie s viacerými zriedených roztokov indikuje vyššia koncentrácia požadovaného antigénu alebo protilátky. Titer správne zaznamenať ako vzájomné zlepenie po zriedení v príklade rozpúšťanie 32, naznačuje, že aglutinácia prebehla v roztoku zriedenej na 1/32 pôvodnej koncentrácie.

Video: Laferobion

Aglutinačné testy zvyčajne rýchlejší, ale menej citlivé, ako mnoho iných metód. Môžu tiež stanoviť sérotypov niektorých baktérií.

doplnkom fixácia. Tento test meria spotrebu komplement (fixácia komplementu) protilátok v sére alebo CSF. Tento test sa používa k diagnostike niektorých vírusových a plesňových infekcií, najmä kokcidioidomykózou. Vzorka inkubuje sa s ním so známym množstvom komplementu a antigénu. Rozsah fixácie komplementu udáva relatívne množstvo protilátok vo vzorke. Tento test môže merať titer protilátok IgG a IgM, alebo môže byť upravený tak, aby detekciu špecifických antigénov. Analýza presné, ale má obmedzené uplatnenie, je časovo náročné a vyžaduje veľa ovládacích prostriedkov.

imunoanalýza. Tieto testy používajú protilátky naviazané na enzýmy, k detekcii antigénov alebo detekciu a kvantifikáciu protilátok. Linked ImmunoSorbent assay (ELISA) a enzýmový imunotest, sú najviac používané Enzyme-Linked-linked ImmunoSorbent (ELISA). Vzhľadom k tomu, najcitlivejších imunotest vysoká, sa bežne používajú na skríning. Titre môže byť určená sériovým riedením vzorky, ako je tomu v aglutinačného testu.

Analýza citlivosti aj keď zvyčajne vysoké a môžu sa líšiť v závislosti od veku pacienta, sérotyp mikróbov, napríklad vzorky alebo klinickom štádiu ochorenia.

analýza zrážok. Tieto testy merajú antigénu alebo protilátky v telesných tekutinách stupňa viditeľného depozície komplexov antigén-protilátka v gélu (agaróza), alebo v roztoku. Existuje mnoho typov analýzy na zrážanie (napr Ouchterlonyho dvojitou difúzie, proti imunoelektroforézy), ale ich použitie je obmedzené. Typicky, vzorka krvi sa zmieša s testovanou antigén pre detekciu protilátok ochranné, často s hubovou infekciou alebo pyogénne meningitídy. Ako pozitívny výsledok vyžaduje veľké množstvo protilátky alebo antigénu, citlivosť je nízka.

Western Blot Analysis. Táto analýza ukazuje, antibakteriálnych protilátok vo vzorke materiálu odobratej z tela pacienta (napr., Sérum, iné telesné tekutiny) ich reakciou s antigénmi (napríklad vírusové zložky), ktoré boli imobilizované na membránovú blot.

Pri Western blot analýzy, spravidla dobrá citlivosť, aj keď je často menšia ako u skríningových testov, ako je ELISA, ale všeobecne má vysokú špecifickosť. To je bežne používané potvrdiť pozitívne výsledky získané v teste skríningu.

Technické zmeny lineárne Western blot imunologických testoch (LIA) - analýza rekombinantnej imunoblotu (RIBA), ktorý používa syntetický alebo rekombináciu-binant vyrábaný antigeny- a imunochromatografický test, ktorý môže rýchlo testovať vzorky pre konkrétny mikrobiálnych antigénov alebo protilátok pacienta.

Metódy identifikácie nie sú nukleovej kyseliny pre detekciu infekčných chorôb

Akonáhle sa skúšobná organizmus kultúra bola identifikovaná, je potrebné identifikovať. Metódy detekcie-non-nukleovej použiť fenotypovej (funkčná alebo morfologické) je k dispozícii mikroorganizmami, skôr než genetickej identifikácie.

Rysy rastu patogénu v živnom médiu - veľkosť kolónií, farba a tvar, poskytujú informácie na identifikáciu druhov a s zafarbením Gram a algoritmu pre ďalšie analýzy. K dispozícii početné biochemické testy- každý charakteristický pre určitý typ mikroorganizmov (napr aeróbne alebo anaeróbne baktérie). Niektorí odhadujú, schopnosť tela využívať celý rad substrátov pre rast. Iné odhady prítomnosť alebo aktivita kľúčových enzýmov (napr., Koaguláza, kataláza). Analýzy sa darí, krok za krokom. testovacie sekvencie je veľmi rôznorodá a v rôznych laboratóriách sa môže mierne líšiť.

Metódy detekcie-non-nukleovej môže byť založené na Manuálu automatizovaných systémov, alebo sa môže jednať o chromatografickej metódy. Niektoré komerčne dostupné kity obsahujú samostatné batérie testov, ktoré možno vykonávať pomocou jediného vzorky materiálu, a je všeobecne užitočný pre diagnostiku širokého spektra mikroorganizmov. Tieto testovacie systémy môžu byť veľmi presné, ale môže trvať dlhšiu dobu, až niekoľko dní.

chromatografické metódy. Mikrobiálne zložky alebo produkty sú oddelené a identifikované za použitia vysokoúčinnej kvapalinovej chromatografie (HPLC) alebo plynovou chromatografiou. Typicky, detekcie je porovnaním mastných kyselín organizmu do databázy. Chromatografické metódy môžu byť použité na identifikáciu aeróbne a anaeróbne baktérie, mykobaktérie a húb. Presnosť závisí od analýzy kvality testovacie kultúry vzorky a kvalite databázy, ktorá môže byť nepresná alebo neúplná.

Metódy na identifikáciu infekčného ochorenia založené na detekcii nukleových kyselín

na identifikáciu nukleových kyselín na základe zobrazenie niektorých metód DNA organizmu alebo RNA extrahované z mikroorganizmu. Tieto sekvencie môžu byť amplifikované in vitro. na detekciu techniky nukleových kyselín na báze sú všeobecne veľmi citlivé a špecifické a môžu byť použité pre všetky typy baktérií. Výsledky možno získať rýchlo. Pretože každá analýza je zvyčajne špecifické pre konkrétne organizmus, lekár potrebuje poznať diagnostické možnosti a požiadať o príslušné analýzy. Napríklad, ak má pacient symptómy, svedčiace chrípky, ale chrípka obdobie je u konca, drží celkom vírusové diagnostický test (napr vírusová kultúra), skôr než zvláštne analýzu chrípke je lepšie, pretože iný vírus (napr, parainfluenzy, adenovírus), môže byť spôsobujú.

na stanovenie nukleových kyselín na báze sú kvalitatívne testy, ale kvantitatívne metódy stanovenia existujú pre obmedzený, ale zvýšenie počtu infekcií (napr. HIV, cytomegalovírus, ľudský T-lymfotrópny virus). Tieto metódy môžu byť užitočné pre diagnostiku a sledovanie odpovede na liečbu.

Metódy, ktoré nezahŕňajú amplifikácii nukleovej kyseliny sa používajú v prípadoch, keď sa organizmus prvýkrát objavený v testovacej kultúry a je prítomná vo vzorke, pri vysokej koncentrácii.

rozšírenie. Vo spôsoboch amplifikácie nukleovej kyseliny, ktoré sa malé množstvo DNA alebo RNA, reprodukovať mnohokrát, a tak môže detekovať malé stopy mikroorganizmu vo vzorke. Tieto metódy sú obzvlášť užitočné pre činidla, ktoré je ťažké kultivovať alebo identifikované pomocou iných metód (napr., Vírusy sú obligatórne intracelulárne patogény, huby, mykobaktérie, niektoré iné baktérie), alebo pre tých organizmy, ktoré sú prítomné v malých množstvách.

Tieto testy môžu zahŕňať cieľové amplifikáciu (napr. PCR, reverzná transkriptáza-PCR [RT-PCR], amplifikácie obvod predpätie, zosilnenie transkripcie) zosilnenie signálu (napríklad analýza rozvetvené DNA hybridný snímanie), amplifikácii vzorky (napr., Reťazová reakcia ligázu , predstavuje formu štiepenie cyklický test) alebo postamplifikatsii analýzu (napr., sekvenovania amplifikovaného produktu, mikročipová analýzy a likvidu krivky analýzy, ako je tomu v PCR v reálnom čase).

Vhodné vzorkovanie a skladovanie pred príchodom do molekulárnej diagnostické laboratória, je dôležité. Vzhľadom k tomu, metód amplifikácie tak citlivé, ľahko k falošne pozitívnym výsledkom z stopové kontaminácii vzorky alebo zariadenia môžu byť inštalované. Napriek vysokej citlivosti, niekedy sú falošne negatívne výsledky, a to aj keď má pacient klinické príznaky (napríklad vírusové infekcie West Nile). Falošne negatívne výsledky môžu byť minimalizované

• vylúčením použitia prútika pre náteroch s drevenými prútmi a špičky vlny
• rýchla preprava vzoriek
• zmrazenie alebo umiestnením vzoriek v chladničke, ak preprava vykonáva >2 hodiny.

Zmrazenie - typický spôsob ukladania testy amplifikácie nukleových kyselín. Avšak, vzorky sa musia uchovávať v chladničke, a nie sú predmetom zmrazenia Ak existuje podozrenie na nestabilné vírusy (napr, herpes zoster, vírus chrípky, HIV-2), alebo ak sa v pláne študovať vírusovej kultúry (mrazené vzorky nie sú vhodné pre štandardné plodiny).