Vhodné "kandidátnej gény" a meta-analýzy pri identifikácii rizikových alel

V posledných 15 rokoch došlo k exponenciálnemu nárastu počtu štúdií o identifikácii kandidátnych génov pre vznik ischemickej choroby srdca. Avšak, nedostatok reprodukovateľnosti údajov o alel kandidátnych génov a ich vzťah s rizikom CHD prasnice pochybnosti medzi epidemiologických genetiky. Väčšina z nich ešte sa odkazuje na výskum akékoľvek jednotlivé jedna substitúcia báz, ktoré môžu byť jednoduchý polymorfizmus a nič neznamená. V súčasnej dobe sa tieto štúdie znížená na tzv meta-analýzy je analýza konkrétne nukleotidové substitúcie v mnohých populáciách. V posledných rokoch publikoval niekoľko meta-analýzy (tab. 1).

Tabuľka 1

Zoznam génu varianty s publikovanými výsledkami meta-analýzy rizika vzniku ischemickej choroby srdca. V niekoľkých vykonaných testoch na rovnakej varianty génu ukazuje iba odkaz na posledný

gen (Varianty)	genotyp, spojená s rizikom	Počet štúdií (číslo prípadu)	Účinok (95% CI)	odkaz
AT1R (1166 >C)	C +	27 (10,180)	1,13 (1,04- 1,23)	Ntzani et al., 2007
MMRZ (5A / 6A)	5A +	8 (3655)	1,26 (1,11- 1,4)	Abilleira et al., 2006
MMP-9 (1562S >T)	T +	5 (4817)	1,11 (1 1.3)	Abilleira et al., 2006
ApoE &epsilon-2, 3, 4	2+ 4+	121 (37,850)	0,8 (0,70- 0,90) 1,06 (0,99- 1,13)	Bennet a kol., 2007
LTA (10G >A)	A +	7 (10,996)	1,09 (1,02- 1,16)	Clarke et al., 2006
LPL (N291S)	S +	21 (1203)	1,48 (1,09- 2)	Hu et al., 2006
AGT (T174M) (M235T)	M + T +	43 (13478)	1,07 (0,93- 1,22) 1,11 (1,03- 1,19)	Xu et al .. 2007
F5 (1691G >A) F7 (10976G >A) F2 (20210G >A) PAI1 (4G / 5G) GP1A (807C >T) GP1BA (5T >C) GP3A (1565 C >T)	A + A + A + 5G + T + C + T +	60 (15,704) 24 (7444) 40 (11625) 37 (11,763) 15 (6414) 14 (6652) 43 (16,984)	1,17 (1,08-1,28) 0,97 (0,91-1,04) 1,31 (1,12-1,52) 1,06 (1,02-1,1) 1,02 (0,97-1,08) 1,05 (0,96-1,13) 1,03 (0,98-1,07)	Ye et al., 2006
IL6 (174G >C)	C +	8 (4799)	1,12 (0,97- 1,29)	Sie et al., 2006
F13 (V34L)	L +	12 (8743)	0,79 (0,66- 0,93)	Shafey et al., 2007

Jednou z najviac študovaných génov kódujúcich plazmy apolipoproteín E, ktorá sa nazýva ApoE. Najbežnejšie ApoE-alela - E3. Existujú aj ďalšie dve možnosti - E4 a E2 (prevalencia týchto alel medzi ľuďmi v Európe je 0,15 a 0,07, v tomto poradí). Zmeny v DNA sekvencie génu vplyv na dva nabité aminokyseliny, ktoré majú vplyv na klírens proteín v plazme a cholesterolu bohaté na lipoproteín nesúce tento proteín. (Obr. 1), ako dôsledok, že je asociácia alel dát s úrovňou plazmatických lipidov (E2 alela znižuje ich koncentráciu a E4 - zvyšuje), čo vedie k tomu, že niekoľko alely E2 znižuje riziko koronárneho srdcového ochorenia a zvyšuje jeho E4 výrazne.

Metaanalýza účinku ApoE genotypu na plazmatických lipidov a rizika rozvoja koronárneho srdcového ochorenia. Pre každú štúdiu kontrolná skupina pozostávala z nefajčiarov s HCV genotypom 3 3. Modifikované (s povolením): Bennet A.M., Di Angelantonio E., Zheng Y. et al. Združenie apolipoproteínu E genotypov s hladiny lipidov a koronárnej riziko // JAMA. - 2007. - N. 298. - P. 1300-1311.

Obr. 1. Metaanalýza účinku ApoE genotypu na plazmatických lipidov a rizika rozvoja koronárneho srdcového ochorenia. Pre každú štúdiu kontrolná skupina pozostávala z nefajčiarov s HCV genotypom 3. marca.

Modifikovaný (s povolením): Bennet A.M., Di Angelantonio E., Zheng Y. a kol. Združenie apolipoproteínu E genotypov s hladiny lipidov a koronárnej riziko // JAMA. - 2007. - N. 298. - P. 1300-1311.

Silvia G. Priori, Carlo Napolitano, Steve E. Humphries a James Skipworth

Genetické aspekty kardiovaskulárnych chorôb

Delež v družabnih omrežjih:

Podobno