Nový spôsob genetickej analýzy často odhalí abnormality plodu

Genetická analýza pomocou DNA mikročipov poskytuje oveľa lepšie výsledky v prenatálnej screening, než tradičný spôsob karyotypizácie.

Tento záver bol americkí vedci.

Vo veľkej skupinové štúdie bolo zistené, že DNA microarrays môže detekovať klinicky významné abnormality, ktoré nemohli byť identifikované v 6% Karyotyping fetálnej DNA vzoriek sa štruktúrnych defektov, a 1,7% vzoriek, ktoré boli vykonané v súvislosti s vekom matky a podozrivé výsledky skríningu. To bolo povedané, Dr Ronald Uopner z Columbia University Medical Center v decembrovom čísle New England Journal of Medicine.

Táto štúdia bola jedna z troch publikovaných prác, že v porovnaní s novú metódu analýzy a karyotypu pre rôzne diagnostické účely.

Uopner lekár a jeho kolegovia uvádzajú, že ich dáta ukázali DNA microarray výhody ako štandardnú súčasť prenatálneho skríningu. Táto metóda pomáha identifikovať ďalšie genetické abnormality ako zastarané metódy karyotypizácie.

Dr. Alexander Radzhkovits, genetik z University of Pittsburgh Medical Center, ktorý nebol zapojený do týchto štúdií, povedal v rozhovore pre on-line vydanie "MedPage Dnes&rdquo-, že mnoho amerických lekári už prešiel na nové metódy v prenatálnom skríningu.

Dr. Radzhkovits poznamenať, že táto metóda, podľa jeho názoru, je to historický okamih vo vývoji genetickej analýzy v posledných rokoch.

DNA microarrays - budúci prenatálny skríning

Karyotypu použitý pre prenatálnu diagnostiku genetických chorôb od roku 1960. Táto metóda bola pre štúdium živých buniek pod mikroskopom na detekciu abnormalít v štruktúre chromozómov.

DNA mikročipy, na druhú stranu ponúka možnosť podrobného štúdia DNA, vrátane identifikácie chýbajúce alebo veľmi malé fragmenty. Aj keď karyotyping neumožňuje zvažovať úseky DNA, aspoň 3 miliónov párov báz genetických čipy môžu detekovať anomálie vo veľkosti fragmentov, niekoľko kilobází.

V skutočnosti dnes, DNA mikročipy sú odporúčané ako diagnostický test v prvej línii s cieľom potvrdiť vývojové abnormality a štrukturálne chyby u malých detí. Ale len veľmi málo klinických štúdií boli vykonávané za účelom zistenia účinnosti tejto metódy v prenatálnom skríningu na identifikáciu genetických ochorení u plodu pred jeho narodením.

Dr Uopner a jeho kolegovia začala rozsiahlu štúdiu. To zahŕňalo 4.406 žien, ktoré boli prenatálne genetické testovanie z rôznych dôvodov, vrátane veku matky, nedefinovaný výsledok skríningu Downovho syndrómu u plodu štrukturálne abnormality na ultrazvuku.

Každá odobratá vzorka bol rozdelený na dve časti, a testované metódou Karyotyping metódy a DNA mikročipov.

Vedci zistili, že mikročipy sú schopní identifikovať všetky aneuploidní a nevyvážené prestavby, ktoré sú viditeľné, keď karyotypizácie. Ale mikročipy nepreukázali žiadne ochorenie, ktoré sú viditeľné na väčšie chromozomálne úrovni, vrátane vyvážených translokáciou a triploid. Avšak, nová technológia uľahčuje detekciu závad na úrovni jednotlivých génov.

U 3,4% vzoriek boli zistené zmeny, ktoré majú neistú klinické hodnotovú z ktorých 72,3% sú nezhubné, iní - patogénne. Obavy z neistým výsledkom skríningu je, že sú veľmi znepokojujúce pre pacientov, často neopodstatnené.

Dr Radzhkovits hovorí matka neistý výsledok tehotenstva je jednou z najväčších obáv a stresory. Tu v tejto chvíli cítil všetku dôležitosť príslušného genetického poradenstva ako profesionálny interpretuje výsledky skúšok vykonaných na dotknutých rodičov a dáva im tie správne odporúčania.

Pomocou novej metódy v stillbirth

V druhej štúdii, Dr Reddy Uma z Národného ústavu zdravia dieťaťa a vývoj človeka zistené, že testovanie pomocou DNA mikročipov poskytuje lepšie výsledky v genetickej diagnostike príčin narodenie mŕtveho dieťaťa.

Výskumníci veria, že 6 až 13% mŕtvo narodených detí v dôsledku genetických abnormalít plodu, ale frekvencia týchto anomálií môže byť vyšší. Mikročipy pomôcť identifikovať také prípady, a to nevyžaduje prítomnosť živých buniek - veľkú výhodu.

Dr. Reddy a jej tím študoval vzorky DNA z 532 mŕtvo narodených detí s cieľom nájsť genetické abnormality. Bolo zistené, že DNA mikročipy sú oveľa pravdepodobnejšie, že k získaniu výsledkov, než Karyotyping (87,5% v porovnaní s 70,5%, P<0.001).

Táto metóda sa ukázala ako spoľahlivá detekcia aneuploidie (8,3% proti 5,8%, p = 0,007), čo dokazuje účinnosť 41,9% (pomer detekčná frekvencia 1,42- 95% CI 1,07 až 1,89 ). Mikročipy ďalšie genetické abnormality detekovaná v špecifických podskupín, vrátane 443 prípadov prenatálnej narodenia mŕtveho plodu (8,8% oproti 6,5%, p = 0,02), a v 67 prípadoch s chybami narodenia mŕtveho plodu rozvoja (29,9% vs 19,4%; p = 0,008).

Rovnako ako v predchádzajúcej štúdii, mikročipy identifikovať ďalšie abnormality s neistým klinický význam než karyotypizácie metódu. Ale vedci k záveru, že to môže byť dokonca užitočné v niektorých prípadoch.

Ďalšia správa strana, výskumníci zameraný na genetické ochorenia s názvom poplatok, ktorý nebol vyriešený buď prenatálne ultrazvukom alebo karyotypizácie alebo DNA čipu.

Dr Cynthia Morton a jej kolegovia na Harvarde použili úplné genomické sekvenovanie diagnostikovať toto ochorenie počas prenatálneho analýzy. V dôsledku toho boli schopní určiť presný bod premiestnenie genetického materiálu. Zistili, že je na 8q12.2 v CHD7 génu (lokus CHARGE-patogénne syndróm), rovnako ako v 6q13 v LMBRD1 génu (locus patogénne recesívny metabolickou poruchou vitamínu B12).

Dr. Kim McBride z Centra pre molekulárnej genetiky v detskej nemocnici v meste Columbus (Ohio, USA), nie je zapojený do štúdie, povedal, že správa obsahuje zaujímavú aplikáciu nových technológií. Dodal, že bol ohromený tým, že vedci boli schopní získať vzorku DNA, pripraviť ho plne analyzovať a vypracovať správu len za dva týždne. Dr. McBride si nie je istý, že táto metóda bude šírená v klinickej praxi, ale to je jedinečná v niektorých prípadoch.

Klady a zápory nového spôsobu

Dr. Lorraine Dugoff University of Pennsylvania poznamenal, že nová štúdia odhalila všetky "energie, zložitosť a nečakané úskalia spojené s používaním nových technológií v klinickej praxi."

Uviedla, že hlavnou nevýhodou novej metódy je neschopnosť interpretovať klinický význam nových, dosiaľ neznámych variantov genetických abnormalít. To znamená, že vedci budú nová výzva - vyvinúť obrovskú databázu neznámych genetických abnormalít je spájať s konkrétnymi patológiou a pochopiť, ktoré z nich nemajú žiadny klinický význam.

Dr. McBride dúfa, že ako nové genetické varianty katalógov, počet neznámych dát bude topiť rýchlo.

V Spojených štátoch, analýza pomocou genetických mikročipov k dispozícii asi za rovnakú cenu ako karyotypizácie. Nová analýza je v hodnote $ 1,500-2,000 v porovnaní s $ 1,000-1,500 na karyotypizácie. Avšak obe metódy vyžadujú invazívne postupy pre odber genetického materiálu, ktorý je spojený s malým rizikom potratu.

Štúdia Dr. Uopnera a Dr Reddy bola vykonaná s podporou zdravia dieťaťa a vývoj človeka Národného inštitútu (NICHD). Všetky mikroarray a činidlá boli poskytnuté Agilent Technologies a Affymetrix.

Delež v družabnih omrežjih:

Podobno